เกณฑ์การรักษาคุณภาพสิ่งแวดล้อมแหล่งธรรมชาติ มีค่าเกณฑ์ที่แสดงถึงคุณภาพของสภาวะแวดล้อม ดังนี้ (1) ด้านองค์ประกอบของระบบนิเวศ/สิ่งแวดล้อม (2) ด้านองค์ประกอบภูมิสถาปัตยกรรมและสถาปัตยกรรม (3) ด้านผลผลิตจากการบริการสิ่งแวดล้อมของแหล่งธรรมชาติ และ (4) ด้านการบริหารจัดการ และได้กำหนดระดับคุณภาพ ไว้ 3 ระดับ ได้แก่ (1) ระดับดี มีค่าคะแนนอยู่ในช่วง 1.00 - 1.66 (2) ระดับปานกลาง มีค่าคะแนนอยู่ในช่วง 1.67 - 2.33 และ (3) ระดับต่ำ (ผลกระทบสูง) มีค่าคะแนนอยู่ในช่วง 2.34 - 3.00 

ในปีงบประมาณ พ.ศ. 2565 ได้ดำเนินการติดตามและประเมินคุณภาพสิ่งแวดล้อมแหล่งธรรมชาติ แหล่งธรรมชาติประเภทธรณีสัณฐานและภูมิลักษณวรรณา ได้รับการประเมิน 67 แห่ง พบว่า อยู่ในระดับดี 66 แห่ง และระดับปานกลาง 1 แห่ง (กองแลน จังหวัดแม่ฮ่องสอน)